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新疆大学有个人文学院，这曾经是它最大、最重要的文科院系。
即使是在被中国殖民的大部分时期里，新疆大学的人文学院也依然在顽强守卫着维吾尔等突厥语文化。距今十多年前，人文学院还保留着一个小有规模的维吾尔语言文学专业，包含了语言文学、文秘文学和影视文学三个方向。历史与艺术仍在被传授，课程包括有：
维吾尔古代文学史、维吾尔现代文学史、维吾尔当代文学史部分、维吾尔文学写作、维吾尔修辞学、维吾尔诗学、阿鲁兹格律、维吾尔古代文学作品选、回鹘语文献导读、察合台文献研究、维吾尔古代文学专题研究、福乐智慧研究、突厥语大辞典研究、纳瓦依研究、维吾尔文学理论研究、维吾尔古代文学论、维吾尔古代文学体裁研究、维吾尔文学批评史、维吾尔诗歌研究、维吾尔戏剧研究，等等等等。
在2007年的招生简章中，这个专业培养的还是：
「具备有关维吾尔民族语言文学全面系统知识，能在少数民族文化教育部门及相关单位从事有关维吾尔民族文学、文字、文献的教学研究、编辑、翻译、新闻、文学创作等方面工作的高级专门人才」。
但是到了2020年，核心课程只剩下了「精读、听力、口语、翻译理论与实践」------意味着它已经从一个主要招收维吾尔人的专业蜕变为了招收汉人学生的专业。招生简章中，这个专业培养的是：
「能够胜任政法机关、公安机关、海关、教育、文化等部门及翻译、新闻传媒等领域工作的复合型人才；能够胜任从事公安、安全等部门的特定工作的复合型人才」。
课程背后的变化更是翻天覆地的------新大人文学院已经在2020年悄然消失了。
2007年时，人文学院从事维吾尔语言文学专业的教师有29名（教授7名，博士6名，副教授12名），其中27人都是维吾尔人或乌兹别克人。
2017年起，一些维吾尔人教授学者陆续人间蒸发。学院里一位声誉斐然的维吾尔民俗学女教授Rahile Dawut在2017年12月消失，没有任何审判，至今音讯全无生死未卜------三年多里她的女儿和丈夫也从没见过她。
到了2018年，整个人文学院只剩3名维吾尔或乌兹别克人教授。
019年起，人文学院的教授列表上已经没有一个个维吾尔人了。学院打头的教授是个汉族人高波，研究方向是「中国现当代诗歌和红色经典」。
2019年1月，新疆大学人文学院合并到了中国语言学院，对外称「人文学院（中国语言学院）」。从2020年下半年开始，人文学院的名字也消失了，只剩下了「中国语言学院」。自此，新疆大学人文学院彻底成为历史。
archive:
新疆大学人文学院中文系用维吾尔语授课的状况
https://www.uyghur-archive.com/uighurbiz-cn/article_3328.html
2020年人文学院招生简章 https://web.archive.org/web/20200930094304/http://rwxy.xju.edu.cn/info/1072/1878.htm
新大院系列表
https://web.archive.org/web/20200601000000*/https://www.xju.edu.cn/zzjg.htm
人文学院师资队伍
https://web.archive.org/web/20180601000000*/http://rwxy.xju.edu.cn/szdw.htm
对研究维吾尔文化的汉族学者的监禁（见数百万份泄密警方档案，揭示中国政府对维吾尔族窒息式的监控）
中国当局害怕外界对新疆公民的影响，这与一项名为"防回流"的政策有关。意思是防止极端主义或其他恐怖主义思想从国外"回流"。
这一举措的一个可能的例子是2018年对上年2月份来新疆大学民俗研究中心担任翻译的中国学者冯斯瑜的监禁。冯是汉族人，原籍杭州，离新疆很远。但根据数据库中2017年10月的一份警方情报说明，她曾在国外留学--包括在阿默斯特学院（Amherst College）、伦敦SOAS大学和印第安纳大学（Indiana University），并在乌鲁木齐受到警方关注。报告记载，冯某的一加智能手机上有"国外加密软件(foreign obscure software)"。该记录还称，该软件是智能手机自带，冯某并未使用。
据信，Feng在2018年2月被判处两年有期徒刑。她被监禁的情况在新疆受害者数据库shahit.biz上有记录（译者注：见这里，这是一个记录当地监禁案例的网站。）
人类学家Steenberg说，他认为冯之所以受到审查，是因为她往返于美国和乌鲁木齐之间，维吾尔语说得很好，也因为她在民间研究中心与其创始人Rahile Dawut共同从事的工作。Dawut是一位著名学者，他收集了新疆南部的民族学资料，包括民间故事和口头文学，以及Sufi伊斯兰教（Sufi Islamic）习俗的资料。Dawut于2017年12月失踪，据信他正被当局关押。
